USA (1990) Dr. Gwen Carpenter hat für die Phoenix-Foundation ein spezielles Sonarsystem entwickelt, mit dem die Drogenfahnder der DEA ihre eigenen U-Boote tarnen und die Drogenschmuggler der kolumbianischen Mafia besser aufspüren können. Doch das System wird noch vor dem ersten Einsatz gestohlen. MacGyver heuert undercover als Computerspezialist bei der Diebesbande an, um zu verhindern, dass das Gerät in falsche Hände gerät. Als die Diebe entdecken, dass das Gerät ohne die Systemdiskette und das Passwort wertlos ist für sie, entführen sie kurzerhand Dr. Gwen Carpenter. Dadurch fliegt MacGyvers Tarnung auf.